一般GNU/Eclipse IDE環境と比較的にEmbedded Studioは満足度が高い使いやすさと高機能デバッグ操作、プロジェクト管理機能をサポートします。

使いやすさ：

• Embedded Studio：VisualStudioのような外観で直感的に操作でき、迷わず使える満足度が高い統合開発環境。IDE起動が早い。新規プロジェクト立ち上げと導入は簡単。
• GNU/Eclipse：IDE起動及びウインドウ・デバッグ操作は遅い。使い勝手に物足りないケースが多い。

技術サポート：

• Embedded Studio：SEGGERより直接技術サポート可能（OEM版のサポート窓口は各ベンダー様にて実装）。各種BSPサンプル、スタートアッププロジェクトに加えてサポートフォーラム、Wikiページでもたくさんの情報を用意しています。
• GNU/Eclipse：Open Community・GNUサポートフォーラム、インターネット上の提示版などにサポート情報がたくさんありすぎて、必要な情報を見つけるのに苦労します。

ライセンス費用：

• Embedded Studio：一般商用統合開発環境と比べてライセンス費用が安い（OEM版は無償で商用利用可能）。非商用利用、学術用途利用、評価目的の無償評価版も提供しています。
• GNU/Eclipse：無償で商用利用可能です。

安定性：

• Embedded Studio：スペックが低いPC・マシン環境でも高速デバッグ操作が安定。
• GNU/Eclipse：複数のプラグインを同時に使用するとIDEが不安定・クラッシュする場合があります。メモリーの消費量が多く、利用するマシンが高いスペックじゃないと満足に操作できない。

プラグイン管理：

• Embedded Studio：基本機能はインストール済みでプラグイン管理は不要。コードエディタ、プロジェクトマネージャ、コンパイラ、コード解析、デバッガなど様々な機能がすぐに利用可能。同じパソコンに複数バージョンのIDEをインストール可能。
• GNU/Eclipse：多種類のプラグインをインストールする必要があり、プラグインの構成管理に手間がかかる。

標準Ｃライブラリ：

• Embedded Studio：SEGGER社で開発・組込アプリケーション向けに最適化された独自のＣライブラリを使用。
• GNU/Eclipse：GCCベースのNewlib・標準Ｃライブラリを使用します。

GPLライセンス制限：

• Embedded Studio：SEGGER社独自のコンパイラ・リンカとSEGGER社の開発したＣライブラリによってGPLによる開示義務のないコード生成と高性能で信頼性の高いコード開発が可能。
• GNU/Eclipse：GPLライセンスによりユーザ開発コードの開示が要求されます。

最適化効率：

• Embedded Studio：SEGGERリンカによる最適化で大幅な最適化効率改善とリンク動作スピードを確保
• GNU/Eclipse：効率の低いGNUコンパイラ・リンカ最適化パフォーマンス

コードエディタ性能：

• Embedded Studio：VisualStudioのような高機能コードエディタをサポート。対応機能：コード補完、簡易ナビゲーション、コードテンプレート、シンタックスハイライト、コードブロック表示、未使用コードのハイライトなど
• GNU/Eclipse：コードエディタ性能は比較的に低い

生成コードの効率：

• Embedded Studio：メモリ使用量表示、コードアウトライン、静的コード解析、スタック使用量解析、シンボルブラウザなど高性能で信頼性の高いコード生成を提供。
• GNU/Eclipse：GNUプロジェクトのプラグインで対応可能ですが、比較的に効率が低い

デバッグ機能：

• Embedded Studio：GDB系デバッグインターフェースと比べてJ-Link/J-Trace経由で高効率・高速のデバッグ操作が可能。
• GNU/Eclipse：GDB系デバッグインターフェースは速度が低いためデバッグ操作の満足度が低い。デバッグ機能が足りない。

ビルド時間：

• Embedded Studio：マルチコアを活用した並列コンパイル機能で、高最適化設定のプロジェクトの場合も高速なビルドを実現。
• GNU/Eclipse：一般的にプロジェクトビルド時間が長い。

外部商用コンパイラサポート：

• Embedded Studio：IAR EWARM / KEIL-MDKなど外部商用コンパイラツールチェーンは使用可能。
• GNU/Eclipse：GNU IDE環境のためGCC以外IAR EWARM / KEIL-MDKコンパイラツールチェーンは使用できません。

命令トレース機能：

• Embedded Studio：MTB/ETMトレース（命令トレース）可能。
• GNU/Eclipse：一般的にEclipse環境でのデバッグポート通信速度は低いため命令トレースは難しいです。

デバッグプローブサポート：

• Embedded Studio：J-Link/J-Trace以外のデバッグプローブは使用できない。
• GNU/Eclipse：GDBサーバー経由でのJ-Linkに加えてオープンソースのOpenOCDデバッグインターフェースは可能です。